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分子互作實驗:CLIP紫外膠聯免疫沉淀

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上海昆盟生物科技有限公司(COWELDGEN SCIENTIFIC)是一家專注于生命科學領域提供相關試劑產品和服務的生物高科技企業(yè),坐落于上海聚科生物產業(yè)園。公司主要提供種類齊全的細胞系和多種原代細胞、質量穩(wěn)定的細胞培養(yǎng)試劑以及檢測試劑產品、成熟高效的技術服務。本著“守正創(chuàng)新,科學嚴謹”的理念,我們以高標準塑造行業(yè)品牌,以全新的視野構建現代企業(yè),勇于探索和創(chuàng)新。公司業(yè)務范圍涉及全國各省市自治區(qū),目前已與國內多家醫(yī)院、高校、科研院所、生物科技公司建立了良好的合作關系,贏得了良好的市場聲譽和廣泛的認可,我們保證將繼續(xù)為廣大科研用戶提供專業(yè)、高效、優(yōu)質的產品及服務!

 

 

 

 

細胞產品,分子試劑,細胞檢測試劑盒,技術服務

一、技術簡介

CLIP(Cross-linking immunoprecipitation,交聯免疫共沉淀)通過結合UV交聯和免疫共沉淀的方法來分析蛋白與RNA相互作用的結合位點。


二、技術原理

CLIP技術利用紫外線照射使細胞內的RNA與RNA結合蛋白(RBP)發(fā)生共價交聯,隨后通過免疫沉淀的方法富集與特定RBP結合的RNA片段,再經過逆轉錄和高通量測序等步驟,獲取RBP在體內的RNA結合位點和結合序列信息。

分子互作實驗:CLIP紫外膠聯免疫沉淀

三、應用場景

1.蛋白質-RNA相互作用研究:確定特定蛋白質在體內的RNA結合位點和結合序列,揭示蛋白質在轉錄后調控中的作用機制。

2.疾病相關研究:通過比較正常和疾病狀態(tài)下RBP的RNA結合情況,發(fā)現與疾病發(fā)生、發(fā)展相關的RNA結合事件和調控網絡。

3.藥物研發(fā):為藥物研發(fā)提供新的靶點和作用機制,幫助開發(fā)針對特定RNA結合蛋白或其調控的RNA分子的藥物。

4.生物信息學分析:通過對CLIP-seq數據的生物信息學分析,預測RNA結合蛋白的結合位點和結合模式,構建RNA調控網絡等。


四、技術優(yōu)勢

1.體內原位檢測:能夠在活體細胞內捕獲蛋白質和RNA的相互作用,真實反映體內的生理狀態(tài)。

2.較高特異性和嚴格的純化:通過特異性抗體或標簽純化交聯復合物,可有效去除非特異性結合的RNA和蛋白質,提高結果的可信度。

3.結合高通量測序:與高通量測序技術結合,可在全基因組范圍內鑒定RBP的RNA結合位點和結合序列,獲取豐富的信息。


五、樣本類型

新鮮細胞(貼壁細胞/懸浮細胞),紫外交聯后細胞樣本。


六、樣本需求

細胞樣本:約1×10^7個(可以是1個10cm皿,或以懸浮細胞形式存儲于離心管中,或1個T75瓶);

交聯細胞樣本:254 nm,150 mJ/cm2標準UV交聯處理細胞。


七、樣本準備&運輸

活細胞樣本:距離較近的可以將養(yǎng)在皿/T75瓶/離心管內的新鮮細胞樣本常溫快遞(最遲次日達)運輸,本市內可閃送或親自遞送;

交聯后細胞樣本:-80℃凍存干冰運輸。


八、需提供的試劑

檢測用ChIP級抗體。


九、實驗周期

1-2周(不包含測序)


十、其他

后續(xù)檢測選擇RT PCR時,需提供后續(xù)檢測的位點。


分子互作實驗:CLIP紫外膠聯免疫沉淀



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