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美國Trikinetics果蠅運(yùn)動(dòng)監(jiān)視器DAM2的數(shù)據(jù)分析

來源:上海溪拓科學(xué)儀器有限公司   2025年02月18日 14:49  

簡(jiǎn)介:

美國Trikinetics 是一家專注于生物行為監(jiān)測(cè)設(shè)備的公司,其DAMDrosophila Activity Monitor)監(jiān)視器主要用于果蠅(Drosophila)活動(dòng)監(jiān)測(cè),廣泛應(yīng)用于睡眠、晝夜節(jié)律及行為研究。

TrikineticsDAM監(jiān)視器憑借其高精度、模塊化設(shè)計(jì)和易用性,成為果蠅行為研究的理想工具。


DAM的原始數(shù)據(jù):

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由于監(jiān)控文件Monitor***.txt 是簡(jiǎn)單的制表符分隔tab-delimited文本文件,因此也可以輸入到任何電子表格或數(shù)學(xué)應(yīng)用程序,直接繪制圖表plotting或進(jìn)行分析analysis。

Monitor***.txt文本文件每行(row)有42列(column,如上圖所示。綠色框代表有效數(shù)據(jù),

紅色框代表monitor的編號(hào),黃色框是數(shù)據(jù)類型(Ct, count,計(jì)數(shù),果蠅阻斷紅外光束),褐色代表有光照(1代表白天,0代表黑夜),藍(lán)色代表阻斷紅外線的次數(shù)。

 

睡眠分析:

果蠅的睡眠定義為持續(xù) 5 分鐘或更長時(shí)間的不間斷行為不活躍(活動(dòng)計(jì)數(shù)為 0)。因此,任何大于或等于五個(gè)連續(xù)零的時(shí)段(bin的長度1min)都被視為睡眠事件(sleep bout)。

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果蠅的睡眠指標(biāo)如上圖。

 

數(shù)據(jù)分析流程

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DAM2的原始數(shù)據(jù)通過TrikineticsDAMSystem3數(shù)據(jù)采集軟件獲得。原始數(shù)據(jù)可以通過各種軟件進(jìn)行作圖和分析。Trikinetics的上提供了多種收費(fèi)和免費(fèi)的軟件,各有優(yōu)劣。包括:ShinyR-damPySolo,SCAMP,RythmicallyCounting macro,Rethomics,VANESSASleepMat,Phase... 溪拓科技提供部分軟件的分析服務(wù)。


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