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當(dāng)前位置:北京百泰派克生物科技有限公司>>檢測(cè)技術(shù)服務(wù)>>蛋白分析>> CUT&Tag與ChIP-seq的對(duì)比分
產(chǎn)品型號(hào)
品 牌百泰派克
廠商性質(zhì)其他
所 在 地北京市
更新時(shí)間:2025-07-22 13:07:57瀏覽次數(shù):13次
聯(lián)系我時(shí),請(qǐng)告知來(lái)自 化工儀器網(wǎng)單細(xì)胞CUT&Tag分析策略及常見(jiàn)挑戰(zhàn)
CUT&Tag數(shù)據(jù)分析完整流程:從測(cè)序到
什么是糖蛋白質(zhì)組學(xué)?檢測(cè)技術(shù)服務(wù)
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表觀遺傳學(xué)研究正以驚人的速度向前發(fā)展,而ChIP-seq和CUT&Tag作為當(dāng)前zuì主流的兩種染色質(zhì)免疫技術(shù),已成為科研人員探索染色質(zhì)狀態(tài)、轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合、組蛋白修飾的重要工具。然而,很多研究者常常陷入困惑:面對(duì)這兩種技術(shù),我究竟應(yīng)該選擇哪一個(gè)?本文將從技術(shù)原理、實(shí)驗(yàn)流程、優(yōu)勢(shì)與局限等多個(gè)角度全面對(duì)比CUT&Tag和ChIP-seq,幫助你輕松做出zuì適合自己研究目標(biāo)的選擇。
一、技術(shù)原理對(duì)比
1、ChIP-seq機(jī)制
ChIP-seq(染色質(zhì)免疫共沉淀測(cè)序)通過(guò)甲醛交聯(lián)固定蛋白與染色質(zhì),再用超聲波將染色質(zhì)打斷成片段,利用特異性抗體捕獲目標(biāo)蛋白-DNA復(fù)合物,zuì后進(jìn)行測(cè)序分析。
2、CUT&Tag機(jī)制
CUT&Tag(Cleavage Under Targets and Tagmentation)則直接使用特異性抗體定位目標(biāo)蛋白,通過(guò)偶聯(lián)的Tn5轉(zhuǎn)座酶直接在目標(biāo)位點(diǎn)附近切割并標(biāo)記染色質(zhì)DNA片段,避免了復(fù)雜的免疫沉淀步驟。
二、實(shí)驗(yàn)流程對(duì)比
CUT&Tag更適合快速獲得數(shù)據(jù)的場(chǎng)景,尤其適合樣本有限的研究。
ChIP-seq更適合已成熟建立且樣本充足的實(shí)驗(yàn)平臺(tái),尤其是針對(duì)難以結(jié)合或特異性較低的抗體。
三、靈敏度與背景噪音對(duì)比
CUT&Tag的高靈敏度、低背景噪音、精細(xì)的分辨率更適合研究精細(xì)的染色質(zhì)動(dòng)態(tài)過(guò)程(例如單細(xì)胞水平)。
ChIP-seq由于免疫沉淀步驟易產(chǎn)生背景干擾,更適合于大規(guī)模、穩(wěn)定表達(dá)蛋白的研究。
四、適用靶點(diǎn)與適用性對(duì)比
CUT&Tag適合組蛋白修飾和高特異性抗體檢測(cè)的轉(zhuǎn)錄因子。
ChIP-seq更適合探測(cè)多種復(fù)雜轉(zhuǎn)錄因子或低親和力靶標(biāo),特別是在足夠細(xì)胞數(shù)量時(shí)。
五、成本與技術(shù)門檻對(duì)比
CUT&Tag的成本低廉,且適合實(shí)驗(yàn)室初次嘗試表觀遺傳學(xué)分析。
ChIP-seq更適合具備成熟技術(shù)平臺(tái)和資金條件的實(shí)驗(yàn)室,尤其在大量高通量需求下更經(jīng)濟(jì)。
在選擇了更適合自己的技術(shù)后,關(guān)鍵就是要保證實(shí)驗(yàn)質(zhì)量和成功率。百泰派克生物科技深耕生命科學(xué)研究領(lǐng)域,擁有穩(wěn)定高效的蛋白A/G-Tn5融合酶及優(yōu)化的一站式CUT&Tag實(shí)驗(yàn)方案,確保每一次實(shí)驗(yàn)高效jīngzhǔn,幫助科研人員輕松完成從實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)到數(shù)據(jù)分析的全流程。無(wú)論是新手還是進(jìn)階用戶,百泰派克生物科技都能為您提供可靠的實(shí)驗(yàn)方案、技術(shù)支持和全面服務(wù),幫助您快速掌握CUT&Tag技術(shù),輕松實(shí)現(xiàn)表觀遺傳研究目標(biāo)。
百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos質(zhì)譜儀及島津公司埃德曼降解測(cè)序系統(tǒng)對(duì)dànbáizhì序列進(jìn)行分析,提供基于質(zhì)譜的蛋白測(cè)序分析服務(wù),包括對(duì)dànbáizhì的氨基酸組成分析,Nduāncèxù,Cduāncèxù和全序列分析,以及基于埃德曼降解的dànbáizhìN端序列分析服務(wù)。對(duì)于未知理論序列的dànbáizhì,提供基于從頭測(cè)序法的dànbáizhì從頭測(cè)序服務(wù),對(duì)蛋白序列進(jìn)行分析。
※服務(wù)優(yōu)勢(shì):
1.采用目前世界上*的質(zhì)譜儀器 Obitrap Fusion Lumos;
2.可實(shí)現(xiàn)對(duì)所測(cè)定靶蛋白序列 100% 的覆蓋;
3.可測(cè)定蛋白N端多達(dá) 70個(gè)氨基酸序列;
4.可測(cè)定多種形式的樣品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白條帶;
5.樣品用量低: 蛋白樣品僅需 5-10ug,即可完成檢測(cè);
6.測(cè)序不受N端封閉,PEC和和糖基化等N端修飾的影響。
百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質(zhì)譜平臺(tái)結(jié)合Nano-LC,提供定量dànbáizhì組學(xué)、靶向dànbáizhì組學(xué)、多肽組學(xué)、翻譯后修飾蛋白組學(xué)等多種dànbáizhì組學(xué)分析服務(wù)。此外,百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4Ddànbáizhì組學(xué)服務(wù),助力微量樣本蛋白組學(xué)、大樣本群醫(yī)學(xué)及高通量修飾組學(xué)等研究工作。
※服務(wù)優(yōu)勢(shì):
1 .高通量定量蛋白分析:多對(duì)照組大規(guī)模實(shí)驗(yàn)分析,發(fā)現(xiàn)新的生物標(biāo)記物;
2.體內(nèi)體外多種dànbáizhì標(biāo)記方法,適用于分析組織、細(xì)胞、血液等多種樣品;
3.質(zhì)譜分析靈敏度高,實(shí)驗(yàn)結(jié)果重復(fù)度高;
4.可檢測(cè)較低豐度蛋白,線性范圍廣;
5.zhuānyè生物信息學(xué)分析,分析更系統(tǒng)準(zhǔn)確。
百泰派克生物科技采用Fluidigm質(zhì)譜流式系統(tǒng)進(jìn)行單細(xì)胞質(zhì)譜流式技術(shù)分析,采用金屬元素標(biāo)記物(通常是金屬元素標(biāo)記的特異抗體)標(biāo)記細(xì)胞表面和內(nèi)部的分子,然后用流式細(xì)胞原理分離單個(gè)細(xì)胞,再用電感耦合等離子體質(zhì)譜(ICP-MS)分析單個(gè)細(xì)胞的原子質(zhì)量譜,zuì后將原子質(zhì)量譜數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換為細(xì)胞表面和內(nèi)部的信號(hào)分子表達(dá)量。
※服務(wù)優(yōu)勢(shì):
1.技術(shù)*,*技術(shù)空白
采用金屬標(biāo)記抗體技術(shù),避免了傳統(tǒng)流式熒光通道少且易相互影響的問(wèn)題??稍趩渭?xì)胞層面上對(duì)多種指標(biāo)同時(shí)進(jìn)行表征,百泰派克生物科技可做到同時(shí)檢測(cè)51個(gè)目標(biāo)蛋白。
2.分析數(shù)量大,成本較低
單細(xì)胞RNAseq受成本等因素限制,所有樣本細(xì)胞匯總的分析數(shù)目一般在2x10^4個(gè)左右,而流式質(zhì)譜技術(shù)一次(單樣本)就可分析至少10^5的細(xì)胞,實(shí)現(xiàn)了數(shù)量級(jí)的提高,且成本不高于單細(xì)胞RNAseq。
3.應(yīng)用前景大
①流式質(zhì)譜結(jié)果可以給出細(xì)胞亞群的變化,在臨床診斷、疾病機(jī)制研究等方面具有極大的研究前景;
②將金屬標(biāo)簽技術(shù)與其他技術(shù)結(jié)合會(huì)有新應(yīng)用方向。除常規(guī)蛋白外,質(zhì)譜流式細(xì)胞技術(shù)還可用于蛋白翻譯后修飾;
③可檢測(cè)細(xì)胞存活率、細(xì)胞大小、mRNA轉(zhuǎn)錄子表達(dá)量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。
百泰派克生物科技的基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學(xué)分析及新抗原發(fā)現(xiàn)一站式解決方案包括我們專有的、高度敏感的免疫肽富集和鑒定方案。我們能夠幫助您實(shí)現(xiàn)10,000個(gè)以上I型多肽和10,000個(gè)以上II型多肽的鑒定和識(shí)別。通過(guò)我們優(yōu)化的高通量免疫多肽組學(xué)分析平臺(tái)進(jìn)行免疫肽組學(xué)分析,可從zuì小的樣品材料中進(jìn)行可重復(fù)的識(shí)別和定量。該服務(wù)可以應(yīng)用于大規(guī)模的研究,旨在助力科研工作者尋找癌癥、免疫疾病及傳染病的解決方案,深入挖掘未知的靶標(biāo)。
百泰派克基于高分辨率質(zhì)譜技術(shù),MALDI TOF,高效色譜分離技術(shù),提供一系列完善的生物藥物分析方案,從dànbáizhì、多肽、抗體、疫苗等生物制品的氨基酸組成和一級(jí)結(jié)構(gòu)分析,到產(chǎn)品變異性和純度分析。旨在提供優(yōu)質(zhì)生物藥物分析服務(wù),幫助生物醫(yī)藥生產(chǎn)商提高生物藥物品質(zhì)。
北京百泰派克生物科技有限公司致力于為生物/制藥和醫(yī)療器械行業(yè)提供質(zhì)量控制檢測(cè)和項(xiàng)目驗(yàn)證等zhuānyè服務(wù)。公司實(shí)驗(yàn)室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法規(guī)和指導(dǎo)原則,通過(guò)CNAS/ISO9001雙重質(zhì)量體系認(rèn)證,建立了完備的質(zhì)量體系,數(shù)據(jù)冷熱/異地備份,設(shè)備定期計(jì)量/期間核查,軟件審計(jì)追蹤,為客戶提供一體化解決方案和技術(shù)服務(wù),支持新藥研發(fā)、藥物申報(bào)注冊(cè)和生產(chǎn)放行。
1.公司采用ISO9001質(zhì)量控制體系,zhuānyè提供以質(zhì)譜為基礎(chǔ)的CRO檢測(cè)分析服務(wù);
2.獲國(guó)家CNAS實(shí)驗(yàn)室認(rèn)可,為客戶提供符合全球藥政法規(guī)的藥物質(zhì)量研究服務(wù);
3.業(yè)務(wù)范圍覆蓋dànbáizhì組學(xué)、多肽組學(xué)、代謝組學(xué)、生物藥物表征、單細(xì)胞分析、單細(xì)胞質(zhì)譜流式、生信云分析以及多組學(xué)生物質(zhì)譜整合分析等;
4.七大質(zhì)量控制檢測(cè)平臺(tái),滿足您一站式服務(wù)需求;
5.服務(wù)3000+企業(yè),10000+客戶的選擇;
6.致力于為您提供優(yōu)質(zhì)的生物質(zhì)譜分析服務(wù)!
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